Protein–RNA interactions for Protein: P21912

SDHB, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHBP21912 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHBP21912 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHBP21912 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHBP21912 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHBP21912 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHBP21912 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHBP21912 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHBP21912 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHBP21912 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDHBP21912 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHBP21912 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHBP21912 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHBP21912 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHBP21912 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHBP21912 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SDHBP21912 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHBP21912 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHBP21912 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHBP21912 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHBP21912 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHBP21912 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHBP21912 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHBP21912 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHBP21912 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHBP21912 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDHBP21912 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHBP21912 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHBP21912 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHBP21912 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHBP21912 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHBP21912 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHBP21912 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHBP21912 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHBP21912 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHBP21912 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHBP21912 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHBP21912 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHBP21912 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDHBP21912 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDHBP21912 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDHBP21912 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHBP21912 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHBP21912 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHBP21912 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHBP21912 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHBP21912 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHBP21912 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHBP21912 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHBP21912 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHBP21912 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHBP21912 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDHBP21912 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHBP21912 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHBP21912 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHBP21912 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHBP21912 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDHBP21912 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHBP21912 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHBP21912 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHBP21912 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHBP21912 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHBP21912 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHBP21912 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHBP21912 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDHBP21912 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHBP21912 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHBP21912 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHBP21912 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHBP21912 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHBP21912 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHBP21912 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHBP21912 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHBP21912 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHBP21912 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHBP21912 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHBP21912 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHBP21912 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHBP21912 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDHBP21912 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHBP21912 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHBP21912 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHBP21912 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHBP21912 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHBP21912 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHBP21912 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHBP21912 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHBP21912 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHBP21912 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHBP21912 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDHBP21912 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDHBP21912 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDHBP21912 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDHBP21912 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDHBP21912 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDHBP21912 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDHBP21912 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDHBP21912 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDHBP21912 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDHBP21912 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SDHBP21912 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms