Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB4AP20338 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms