Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC9A1P19634 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC9A1P19634 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9A1P19634 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms