Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD53P19397 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD53P19397 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD53P19397 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD53P19397 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD53P19397 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD53P19397 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD53P19397 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CD53P19397 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD53P19397 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD53P19397 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD53P19397 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD53P19397 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CD53P19397 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD53P19397 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD53P19397 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD53P19397 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD53P19397 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD53P19397 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD53P19397 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD53P19397 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD53P19397 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CD53P19397 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD53P19397 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD53P19397 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD53P19397 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD53P19397 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD53P19397 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD53P19397 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD53P19397 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD53P19397 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CD53P19397 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD53P19397 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD53P19397 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CD53P19397 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CD53P19397 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CD53P19397 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CD53P19397 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD53P19397 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD53P19397 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD53P19397 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD53P19397 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD53P19397 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD53P19397 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD53P19397 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD53P19397 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD53P19397 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD53P19397 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD53P19397 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD53P19397 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD53P19397 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD53P19397 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD53P19397 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD53P19397 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD53P19397 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD53P19397 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD53P19397 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD53P19397 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD53P19397 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD53P19397 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD53P19397 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD53P19397 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CD53P19397 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD53P19397 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD53P19397 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD53P19397 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD53P19397 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD53P19397 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD53P19397 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD53P19397 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD53P19397 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD53P19397 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD53P19397 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD53P19397 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CD53P19397 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD53P19397 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD53P19397 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD53P19397 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD53P19397 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD53P19397 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD53P19397 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD53P19397 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD53P19397 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD53P19397 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD53P19397 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CD53P19397 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD53P19397 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD53P19397 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD53P19397 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD53P19397 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD53P19397 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD53P19397 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD53P19397 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CD53P19397 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CD53P19397 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD53P19397 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD53P19397 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CD53P19397 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD53P19397 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD53P19397 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms