Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCC1P18754 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCC1P18754 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCC1P18754 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCC1P18754 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RCC1P18754 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCC1P18754 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCC1P18754 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCC1P18754 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCC1P18754 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCC1P18754 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RCC1P18754 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RCC1P18754 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RCC1P18754 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RCC1P18754 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RCC1P18754 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RCC1P18754 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RCC1P18754 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RCC1P18754 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RCC1P18754 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RCC1P18754 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RCC1P18754 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RCC1P18754 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RCC1P18754 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RCC1P18754 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RCC1P18754 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RCC1P18754 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RCC1P18754 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RCC1P18754 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RCC1P18754 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RCC1P18754 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RCC1P18754 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RCC1P18754 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RCC1P18754 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RCC1P18754 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RCC1P18754 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RCC1P18754 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RCC1P18754 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCC1P18754 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCC1P18754 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCC1P18754 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCC1P18754 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCC1P18754 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCC1P18754 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCC1P18754 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RCC1P18754 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCC1P18754 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCC1P18754 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCC1P18754 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCC1P18754 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCC1P18754 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCC1P18754 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCC1P18754 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCC1P18754 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCC1P18754 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCC1P18754 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RCC1P18754 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCC1P18754 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RCC1P18754 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RCC1P18754 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCC1P18754 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCC1P18754 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCC1P18754 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCC1P18754 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCC1P18754 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCC1P18754 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCC1P18754 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCC1P18754 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RCC1P18754 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCC1P18754 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCC1P18754 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCC1P18754 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCC1P18754 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCC1P18754 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCC1P18754 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCC1P18754 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCC1P18754 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCC1P18754 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCC1P18754 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RCC1P18754 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCC1P18754 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCC1P18754 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCC1P18754 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCC1P18754 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCC1P18754 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCC1P18754 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCC1P18754 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCC1P18754 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCC1P18754 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCC1P18754 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RCC1P18754 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCC1P18754 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCC1P18754 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCC1P18754 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCC1P18754 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCC1P18754 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCC1P18754 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCC1P18754 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCC1P18754 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RCC1P18754 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms