Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPI1P17947 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPI1P17947 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPI1P17947 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPI1P17947 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SPI1P17947 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPI1P17947 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPI1P17947 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPI1P17947 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPI1P17947 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPI1P17947 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPI1P17947 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPI1P17947 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SPI1P17947 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPI1P17947 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPI1P17947 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPI1P17947 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPI1P17947 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPI1P17947 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPI1P17947 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPI1P17947 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPI1P17947 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPI1P17947 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPI1P17947 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPI1P17947 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPI1P17947 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPI1P17947 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPI1P17947 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPI1P17947 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SPI1P17947 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPI1P17947 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPI1P17947 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SPI1P17947 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SPI1P17947 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SPI1P17947 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPI1P17947 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPI1P17947 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPI1P17947 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPI1P17947 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPI1P17947 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPI1P17947 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPI1P17947 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPI1P17947 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPI1P17947 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPI1P17947 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPI1P17947 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPI1P17947 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SPI1P17947 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPI1P17947 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPI1P17947 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPI1P17947 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPI1P17947 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPI1P17947 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPI1P17947 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPI1P17947 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPI1P17947 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPI1P17947 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPI1P17947 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPI1P17947 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPI1P17947 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPI1P17947 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPI1P17947 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPI1P17947 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPI1P17947 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPI1P17947 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPI1P17947 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPI1P17947 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPI1P17947 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SPI1P17947 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPI1P17947 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPI1P17947 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPI1P17947 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SPI1P17947 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPI1P17947 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPI1P17947 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPI1P17947 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPI1P17947 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPI1P17947 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPI1P17947 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPI1P17947 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SPI1P17947 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPI1P17947 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPI1P17947 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPI1P17947 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPI1P17947 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPI1P17947 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPI1P17947 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPI1P17947 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPI1P17947 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPI1P17947 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPI1P17947 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPI1P17947 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPI1P17947 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPI1P17947 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPI1P17947 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPI1P17947 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPI1P17947 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPI1P17947 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPI1P17947 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPI1P17947 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms