Protein–RNA interactions for Protein: P17509

HOXB6, Homeobox protein Hox-B6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB6P17509 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
HOXB6P17509 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXB6P17509 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB6P17509 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB6P17509 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB6P17509 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB6P17509 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB6P17509 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB6P17509 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB6P17509 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB6P17509 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB6P17509 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB6P17509 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXB6P17509 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB6P17509 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB6P17509 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB6P17509 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB6P17509 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB6P17509 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB6P17509 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB6P17509 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB6P17509 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB6P17509 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB6P17509 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB6P17509 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB6P17509 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB6P17509 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms