Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPA1P15085 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPA1P15085 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPA1P15085 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPA1P15085 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPA1P15085 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPA1P15085 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPA1P15085 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CPA1P15085 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPA1P15085 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPA1P15085 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPA1P15085 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CPA1P15085 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CPA1P15085 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPA1P15085 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CPA1P15085 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPA1P15085 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPA1P15085 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPA1P15085 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CPA1P15085 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPA1P15085 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPA1P15085 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPA1P15085 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPA1P15085 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CPA1P15085 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPA1P15085 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPA1P15085 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPA1P15085 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPA1P15085 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPA1P15085 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPA1P15085 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPA1P15085 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPA1P15085 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPA1P15085 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPA1P15085 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPA1P15085 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPA1P15085 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPA1P15085 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPA1P15085 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPA1P15085 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPA1P15085 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPA1P15085 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPA1P15085 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPA1P15085 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPA1P15085 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPA1P15085 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPA1P15085 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CPA1P15085 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPA1P15085 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPA1P15085 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPA1P15085 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPA1P15085 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPA1P15085 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CPA1P15085 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPA1P15085 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPA1P15085 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CPA1P15085 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPA1P15085 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPA1P15085 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CPA1P15085 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CPA1P15085 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPA1P15085 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPA1P15085 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CPA1P15085 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPA1P15085 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPA1P15085 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPA1P15085 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPA1P15085 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPA1P15085 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPA1P15085 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPA1P15085 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPA1P15085 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPA1P15085 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPA1P15085 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPA1P15085 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPA1P15085 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPA1P15085 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPA1P15085 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPA1P15085 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPA1P15085 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPA1P15085 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPA1P15085 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CPA1P15085 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPA1P15085 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPA1P15085 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPA1P15085 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CPA1P15085 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPA1P15085 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPA1P15085 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPA1P15085 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPA1P15085 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPA1P15085 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPA1P15085 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPA1P15085 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPA1P15085 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPA1P15085 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPA1P15085 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPA1P15085 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPA1P15085 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPA1P15085 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms