Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB3P14651 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB3P14651 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms