Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HOXD8P13378 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXD8P13378 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD8P13378 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms