Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF1P10914 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF1P10914 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF1P10914 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF1P10914 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF1P10914 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF1P10914 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF1P10914 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF1P10914 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF1P10914 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF1P10914 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF1P10914 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF1P10914 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF1P10914 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF1P10914 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF1P10914 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF1P10914 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF1P10914 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF1P10914 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF1P10914 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF1P10914 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF1P10914 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF1P10914 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF1P10914 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF1P10914 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF1P10914 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF1P10914 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF1P10914 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF1P10914 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF1P10914 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IRF1P10914 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRF1P10914 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRF1P10914 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRF1P10914 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRF1P10914 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IRF1P10914 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF1P10914 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF1P10914 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF1P10914 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF1P10914 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF1P10914 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF1P10914 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF1P10914 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF1P10914 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF1P10914 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF1P10914 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF1P10914 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF1P10914 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF1P10914 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF1P10914 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF1P10914 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF1P10914 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF1P10914 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF1P10914 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF1P10914 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF1P10914 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF1P10914 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF1P10914 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF1P10914 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF1P10914 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF1P10914 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF1P10914 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF1P10914 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF1P10914 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF1P10914 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF1P10914 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF1P10914 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF1P10914 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF1P10914 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF1P10914 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF1P10914 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF1P10914 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF1P10914 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF1P10914 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF1P10914 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF1P10914 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF1P10914 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF1P10914 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF1P10914 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF1P10914 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF1P10914 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF1P10914 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF1P10914 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF1P10914 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF1P10914 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF1P10914 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRF1P10914 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRF1P10914 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRF1P10914 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRF1P10914 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRF1P10914 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRF1P10914 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRF1P10914 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF1P10914 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF1P10914 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF1P10914 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF1P10914 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF1P10914 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF1P10914 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF1P10914 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms