Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHGAP10645 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHGAP10645 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHGAP10645 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHGAP10645 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHGAP10645 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
CHGAP10645 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHGAP10645 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHGAP10645 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHGAP10645 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHGAP10645 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHGAP10645 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHGAP10645 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHGAP10645 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CHGAP10645 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHGAP10645 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHGAP10645 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CHGAP10645 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHGAP10645 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHGAP10645 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHGAP10645 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHGAP10645 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHGAP10645 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHGAP10645 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHGAP10645 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHGAP10645 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHGAP10645 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHGAP10645 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHGAP10645 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHGAP10645 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHGAP10645 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHGAP10645 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHGAP10645 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHGAP10645 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHGAP10645 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CHGAP10645 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CHGAP10645 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CHGAP10645 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CHGAP10645 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CHGAP10645 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CHGAP10645 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CHGAP10645 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CHGAP10645 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CHGAP10645 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CHGAP10645 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CHGAP10645 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CHGAP10645 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CHGAP10645 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CHGAP10645 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CHGAP10645 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CHGAP10645 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CHGAP10645 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CHGAP10645 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CHGAP10645 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CHGAP10645 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CHGAP10645 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CHGAP10645 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CHGAP10645 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CHGAP10645 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CHGAP10645 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CHGAP10645 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
CHGAP10645 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CHGAP10645 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CHGAP10645 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CHGAP10645 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CHGAP10645 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CHGAP10645 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CHGAP10645 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CHGAP10645 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CHGAP10645 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CHGAP10645 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CHGAP10645 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
CHGAP10645 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CHGAP10645 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CHGAP10645 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CHGAP10645 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CHGAP10645 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
CHGAP10645 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
CHGAP10645 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
CHGAP10645 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
CHGAP10645 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CHGAP10645 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CHGAP10645 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CHGAP10645 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CHGAP10645 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CHGAP10645 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
CHGAP10645 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHGAP10645 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHGAP10645 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHGAP10645 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHGAP10645 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHGAP10645 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHGAP10645 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHGAP10645 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHGAP10645 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHGAP10645 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHGAP10645 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHGAP10645 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHGAP10645 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHGAP10645 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms