Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C8orf89P0DMQ9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf89P0DMQ9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C8orf89P0DMQ9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms