Protein–RNA interactions for Protein: P0CG40

SP9, Transcription factor Sp9, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP9P0CG40 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP9P0CG40 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP9P0CG40 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms