Protein–RNA interactions for Protein: P0CG20

PRR35, Proline-rich protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR35P0CG20 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR35P0CG20 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms