Protein–RNA interactions for Protein: P09497

CLTB, Clathrin light chain B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTBP09497 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLTBP09497 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTBP09497 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTBP09497 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTBP09497 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTBP09497 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTBP09497 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTBP09497 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTBP09497 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTBP09497 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTBP09497 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTBP09497 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTBP09497 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLTBP09497 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTBP09497 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTBP09497 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTBP09497 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTBP09497 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTBP09497 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTBP09497 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTBP09497 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTBP09497 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTBP09497 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTBP09497 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLTBP09497 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTBP09497 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTBP09497 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTBP09497 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTBP09497 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTBP09497 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTBP09497 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTBP09497 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTBP09497 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTBP09497 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTBP09497 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTBP09497 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTBP09497 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTBP09497 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLTBP09497 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTBP09497 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTBP09497 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTBP09497 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTBP09497 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTBP09497 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLTBP09497 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLTBP09497 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTBP09497 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTBP09497 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTBP09497 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTBP09497 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTBP09497 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTBP09497 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTBP09497 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTBP09497 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTBP09497 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTBP09497 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTBP09497 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTBP09497 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTBP09497 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTBP09497 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTBP09497 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTBP09497 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLTBP09497 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTBP09497 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTBP09497 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTBP09497 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTBP09497 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTBP09497 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTBP09497 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTBP09497 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLTBP09497 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTBP09497 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTBP09497 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTBP09497 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTBP09497 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTBP09497 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTBP09497 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTBP09497 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLTBP09497 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTBP09497 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTBP09497 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTBP09497 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLTBP09497 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLTBP09497 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLTBP09497 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CLTBP09497 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTBP09497 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTBP09497 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTBP09497 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTBP09497 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTBP09497 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTBP09497 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTBP09497 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTBP09497 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTBP09497 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTBP09497 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTBP09497 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLTBP09497 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLTBP09497 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLTBP09497 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms