Protein–RNA interactions for Protein: P09455

RBP1, Retinol-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP1P09455 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP1P09455 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP1P09455 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP1P09455 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP1P09455 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP1P09455 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP1P09455 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP1P09455 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP1P09455 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP1P09455 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBP1P09455 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP1P09455 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP1P09455 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP1P09455 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP1P09455 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP1P09455 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP1P09455 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP1P09455 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP1P09455 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP1P09455 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP1P09455 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP1P09455 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBP1P09455 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP1P09455 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP1P09455 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP1P09455 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP1P09455 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP1P09455 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP1P09455 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP1P09455 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP1P09455 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP1P09455 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP1P09455 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP1P09455 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBP1P09455 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBP1P09455 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBP1P09455 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBP1P09455 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBP1P09455 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBP1P09455 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RBP1P09455 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBP1P09455 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBP1P09455 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP1P09455 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP1P09455 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP1P09455 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP1P09455 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP1P09455 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP1P09455 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP1P09455 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP1P09455 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP1P09455 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP1P09455 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP1P09455 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP1P09455 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP1P09455 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP1P09455 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP1P09455 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBP1P09455 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP1P09455 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP1P09455 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP1P09455 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP1P09455 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP1P09455 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP1P09455 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP1P09455 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP1P09455 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP1P09455 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBP1P09455 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP1P09455 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP1P09455 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP1P09455 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP1P09455 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP1P09455 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP1P09455 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP1P09455 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP1P09455 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP1P09455 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP1P09455 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP1P09455 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP1P09455 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP1P09455 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP1P09455 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBP1P09455 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP1P09455 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP1P09455 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP1P09455 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP1P09455 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP1P09455 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP1P09455 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP1P09455 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP1P09455 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP1P09455 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP1P09455 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP1P09455 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP1P09455 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP1P09455 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP1P09455 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP1P09455 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP1P09455 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms