Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRPRAP08240 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms