Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CENPBP07199 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CENPBP07199 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CENPBP07199 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CENPBP07199 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CENPBP07199 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CENPBP07199 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CENPBP07199 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CENPBP07199 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CENPBP07199 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CENPBP07199 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CENPBP07199 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CENPBP07199 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CENPBP07199 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CENPBP07199 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CENPBP07199 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CENPBP07199 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CENPBP07199 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CENPBP07199 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CENPBP07199 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CENPBP07199 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CENPBP07199 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CENPBP07199 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CENPBP07199 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CENPBP07199 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CENPBP07199 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CENPBP07199 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CENPBP07199 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CENPBP07199 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CENPBP07199 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CENPBP07199 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CENPBP07199 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CENPBP07199 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CENPBP07199 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CENPBP07199 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
CENPBP07199 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CENPBP07199 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CENPBP07199 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CENPBP07199 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CENPBP07199 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
CENPBP07199 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CENPBP07199 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CENPBP07199 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CENPBP07199 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CENPBP07199 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CENPBP07199 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CENPBP07199 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CENPBP07199 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CENPBP07199 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CENPBP07199 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CENPBP07199 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CENPBP07199 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CENPBP07199 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CENPBP07199 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CENPBP07199 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CENPBP07199 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CENPBP07199 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CENPBP07199 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CENPBP07199 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CENPBP07199 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CENPBP07199 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CENPBP07199 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CENPBP07199 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CENPBP07199 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CENPBP07199 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CENPBP07199 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CENPBP07199 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CENPBP07199 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CENPBP07199 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CENPBP07199 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CENPBP07199 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CENPBP07199 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CENPBP07199 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CENPBP07199 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CENPBP07199 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CENPBP07199 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CENPBP07199 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CENPBP07199 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CENPBP07199 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CENPBP07199 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CENPBP07199 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CENPBP07199 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CENPBP07199 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CENPBP07199 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CENPBP07199 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CENPBP07199 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CENPBP07199 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CENPBP07199 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CENPBP07199 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CENPBP07199 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CENPBP07199 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CENPBP07199 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CENPBP07199 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CENPBP07199 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CENPBP07199 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CENPBP07199 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CENPBP07199 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CENPBP07199 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CENPBP07199 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CENPBP07199 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms