Protein–RNA interactions for Protein: P06732

CKM, Creatine kinase M-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMP06732 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKMP06732 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKMP06732 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CKMP06732 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKMP06732 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKMP06732 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKMP06732 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKMP06732 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKMP06732 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKMP06732 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKMP06732 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CKMP06732 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKMP06732 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKMP06732 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKMP06732 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKMP06732 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKMP06732 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CKMP06732 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CKMP06732 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKMP06732 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKMP06732 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKMP06732 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKMP06732 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKMP06732 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKMP06732 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKMP06732 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKMP06732 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CKMP06732 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKMP06732 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKMP06732 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKMP06732 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKMP06732 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKMP06732 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKMP06732 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKMP06732 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKMP06732 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CKMP06732 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKMP06732 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKMP06732 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKMP06732 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKMP06732 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKMP06732 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKMP06732 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKMP06732 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKMP06732 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKMP06732 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKMP06732 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CKMP06732 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CKMP06732 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CKMP06732 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKMP06732 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKMP06732 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKMP06732 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CKMP06732 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKMP06732 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKMP06732 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKMP06732 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CKMP06732 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CKMP06732 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CKMP06732 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CKMP06732 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CKMP06732 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CKMP06732 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CKMP06732 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CKMP06732 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CKMP06732 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CKMP06732 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CKMP06732 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CKMP06732 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKMP06732 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKMP06732 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKMP06732 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKMP06732 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKMP06732 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKMP06732 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKMP06732 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CKMP06732 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKMP06732 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKMP06732 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKMP06732 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKMP06732 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKMP06732 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CKMP06732 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKMP06732 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CKMP06732 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CKMP06732 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CKMP06732 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CKMP06732 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKMP06732 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKMP06732 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKMP06732 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKMP06732 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKMP06732 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKMP06732 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKMP06732 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKMP06732 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKMP06732 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKMP06732 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKMP06732 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKMP06732 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms