Protein–RNA interactions for Protein: P06731

CEACAM5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM5P06731 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CEACAM5P06731 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEACAM5P06731 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms