Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA4P06727 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA4P06727 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA4P06727 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA4P06727 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA4P06727 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA4P06727 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA4P06727 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA4P06727 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOA4P06727 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOA4P06727 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOA4P06727 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOA4P06727 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOA4P06727 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOA4P06727 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOA4P06727 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA4P06727 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA4P06727 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA4P06727 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA4P06727 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA4P06727 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA4P06727 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOA4P06727 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA4P06727 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA4P06727 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA4P06727 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA4P06727 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA4P06727 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA4P06727 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA4P06727 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA4P06727 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA4P06727 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA4P06727 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA4P06727 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA4P06727 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA4P06727 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOA4P06727 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOA4P06727 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOA4P06727 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOA4P06727 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOA4P06727 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOA4P06727 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA4P06727 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA4P06727 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA4P06727 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA4P06727 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA4P06727 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA4P06727 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA4P06727 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA4P06727 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA4P06727 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA4P06727 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA4P06727 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA4P06727 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA4P06727 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA4P06727 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOA4P06727 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOA4P06727 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOA4P06727 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOA4P06727 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOA4P06727 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOA4P06727 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOA4P06727 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
APOA4P06727 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA4P06727 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA4P06727 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA4P06727 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA4P06727 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA4P06727 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA4P06727 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA4P06727 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA4P06727 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA4P06727 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA4P06727 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA4P06727 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA4P06727 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA4P06727 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA4P06727 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA4P06727 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA4P06727 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA4P06727 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA4P06727 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA4P06727 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA4P06727 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA4P06727 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA4P06727 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA4P06727 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA4P06727 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA4P06727 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA4P06727 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA4P06727 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA4P06727 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA4P06727 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA4P06727 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA4P06727 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA4P06727 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA4P06727 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA4P06727 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA4P06727 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA4P06727 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms