Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTMAP06454 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTMAP06454 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTMAP06454 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTMAP06454 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTMAP06454 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTMAP06454 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTMAP06454 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTMAP06454 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTMAP06454 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTMAP06454 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTMAP06454 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTMAP06454 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTMAP06454 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTMAP06454 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTMAP06454 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTMAP06454 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTMAP06454 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTMAP06454 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTMAP06454 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTMAP06454 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTMAP06454 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTMAP06454 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTMAP06454 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTMAP06454 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTMAP06454 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTMAP06454 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTMAP06454 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTMAP06454 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTMAP06454 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTMAP06454 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTMAP06454 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTMAP06454 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTMAP06454 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTMAP06454 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTMAP06454 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTMAP06454 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTMAP06454 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTMAP06454 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTMAP06454 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTMAP06454 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTMAP06454 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTMAP06454 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTMAP06454 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTMAP06454 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTMAP06454 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTMAP06454 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTMAP06454 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTMAP06454 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTMAP06454 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTMAP06454 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTMAP06454 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTMAP06454 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTMAP06454 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTMAP06454 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTMAP06454 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTMAP06454 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTMAP06454 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTMAP06454 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTMAP06454 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTMAP06454 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTMAP06454 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTMAP06454 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTMAP06454 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTMAP06454 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTMAP06454 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTMAP06454 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTMAP06454 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTMAP06454 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTMAP06454 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTMAP06454 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTMAP06454 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTMAP06454 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTMAP06454 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTMAP06454 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTMAP06454 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTMAP06454 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTMAP06454 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTMAP06454 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTMAP06454 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTMAP06454 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTMAP06454 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTMAP06454 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTMAP06454 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTMAP06454 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTMAP06454 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTMAP06454 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTMAP06454 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTMAP06454 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTMAP06454 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTMAP06454 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTMAP06454 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTMAP06454 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTMAP06454 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTMAP06454 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTMAP06454 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTMAP06454 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTMAP06454 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTMAP06454 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTMAP06454 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms