Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
COL2A1P02458 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
COL2A1P02458 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL2A1P02458 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL2A1P02458 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms