Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASS1P00966 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASS1P00966 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASS1P00966 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASS1P00966 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASS1P00966 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASS1P00966 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASS1P00966 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASS1P00966 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASS1P00966 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASS1P00966 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASS1P00966 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASS1P00966 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASS1P00966 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASS1P00966 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASS1P00966 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ASS1P00966 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASS1P00966 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASS1P00966 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASS1P00966 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASS1P00966 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ASS1P00966 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASS1P00966 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASS1P00966 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASS1P00966 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASS1P00966 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ASS1P00966 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASS1P00966 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ASS1P00966 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASS1P00966 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASS1P00966 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASS1P00966 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASS1P00966 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASS1P00966 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASS1P00966 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASS1P00966 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ASS1P00966 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ASS1P00966 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASS1P00966 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASS1P00966 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASS1P00966 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASS1P00966 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASS1P00966 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ASS1P00966 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASS1P00966 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASS1P00966 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASS1P00966 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASS1P00966 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ASS1P00966 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASS1P00966 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASS1P00966 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ASS1P00966 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ASS1P00966 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ASS1P00966 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ASS1P00966 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ASS1P00966 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASS1P00966 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASS1P00966 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASS1P00966 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASS1P00966 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ASS1P00966 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASS1P00966 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASS1P00966 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASS1P00966 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASS1P00966 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ASS1P00966 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASS1P00966 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASS1P00966 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASS1P00966 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASS1P00966 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASS1P00966 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASS1P00966 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASS1P00966 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASS1P00966 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASS1P00966 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASS1P00966 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ASS1P00966 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASS1P00966 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASS1P00966 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASS1P00966 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASS1P00966 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASS1P00966 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASS1P00966 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASS1P00966 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASS1P00966 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ASS1P00966 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASS1P00966 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASS1P00966 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASS1P00966 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASS1P00966 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASS1P00966 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASS1P00966 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ASS1P00966 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ASS1P00966 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ASS1P00966 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ASS1P00966 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ASS1P00966 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ASS1P00966 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ASS1P00966 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ASS1P00966 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms