Protein–RNA interactions for Protein: P00739

HPR, Haptoglobin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPRP00739 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPRP00739 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPRP00739 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPRP00739 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPRP00739 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPRP00739 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPRP00739 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPRP00739 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPRP00739 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPRP00739 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPRP00739 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPRP00739 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPRP00739 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPRP00739 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPRP00739 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPRP00739 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPRP00739 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPRP00739 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPRP00739 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPRP00739 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HPRP00739 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPRP00739 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPRP00739 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPRP00739 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPRP00739 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPRP00739 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPRP00739 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPRP00739 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPRP00739 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPRP00739 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPRP00739 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPRP00739 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HPRP00739 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HPRP00739 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPRP00739 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HPRP00739 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPRP00739 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPRP00739 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPRP00739 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPRP00739 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPRP00739 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPRP00739 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPRP00739 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPRP00739 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPRP00739 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPRP00739 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPRP00739 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPRP00739 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPRP00739 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPRP00739 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPRP00739 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPRP00739 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPRP00739 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPRP00739 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPRP00739 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPRP00739 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPRP00739 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPRP00739 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPRP00739 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPRP00739 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPRP00739 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HPRP00739 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPRP00739 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPRP00739 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPRP00739 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HPRP00739 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPRP00739 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPRP00739 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPRP00739 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPRP00739 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HPRP00739 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPRP00739 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPRP00739 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPRP00739 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPRP00739 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HPRP00739 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPRP00739 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPRP00739 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPRP00739 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPRP00739 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPRP00739 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPRP00739 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPRP00739 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HPRP00739 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HPRP00739 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HPRP00739 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HPRP00739 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HPRP00739 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HPRP00739 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HPRP00739 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HPRP00739 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HPRP00739 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HPRP00739 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HPRP00739 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HPRP00739 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HPRP00739 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HPRP00739 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HPRP00739 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HPRP00739 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HPRP00739 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms