Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PEX11BO96011 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PEX11BO96011 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.6 ms