Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRUB2O95900 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms