Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX58O95786 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX58O95786 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX58O95786 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX58O95786 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX58O95786 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX58O95786 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX58O95786 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX58O95786 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX58O95786 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX58O95786 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX58O95786 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX58O95786 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX58O95786 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX58O95786 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX58O95786 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX58O95786 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX58O95786 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX58O95786 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX58O95786 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX58O95786 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX58O95786 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX58O95786 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX58O95786 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX58O95786 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX58O95786 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX58O95786 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX58O95786 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX58O95786 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX58O95786 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX58O95786 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX58O95786 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX58O95786 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX58O95786 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX58O95786 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX58O95786 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX58O95786 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX58O95786 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX58O95786 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX58O95786 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX58O95786 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX58O95786 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX58O95786 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX58O95786 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
DDX58O95786 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
DDX58O95786 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX58O95786 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX58O95786 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX58O95786 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX58O95786 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX58O95786 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX58O95786 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX58O95786 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX58O95786 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX58O95786 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX58O95786 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX58O95786 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX58O95786 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX58O95786 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX58O95786 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX58O95786 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX58O95786 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX58O95786 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX58O95786 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX58O95786 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX58O95786 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX58O95786 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX58O95786 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX58O95786 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX58O95786 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX58O95786 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX58O95786 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX58O95786 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX58O95786 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX58O95786 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX58O95786 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX58O95786 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX58O95786 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX58O95786 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX58O95786 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX58O95786 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX58O95786 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX58O95786 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX58O95786 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX58O95786 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX58O95786 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX58O95786 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX58O95786 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
DDX58O95786 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX58O95786 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX58O95786 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX58O95786 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX58O95786 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX58O95786 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX58O95786 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX58O95786 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX58O95786 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX58O95786 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX58O95786 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX58O95786 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms