Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN4O95460 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN4O95460 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN4O95460 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN4O95460 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MATN4O95460 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MATN4O95460 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MATN4O95460 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MATN4O95460 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MATN4O95460 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MATN4O95460 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MATN4O95460 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MATN4O95460 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MATN4O95460 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MATN4O95460 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MATN4O95460 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MATN4O95460 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MATN4O95460 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MATN4O95460 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MATN4O95460 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MATN4O95460 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MATN4O95460 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MATN4O95460 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MATN4O95460 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MATN4O95460 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MATN4O95460 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MATN4O95460 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MATN4O95460 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MATN4O95460 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MATN4O95460 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MATN4O95460 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MATN4O95460 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MATN4O95460 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MATN4O95460 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MATN4O95460 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MATN4O95460 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MATN4O95460 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MATN4O95460 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MATN4O95460 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MATN4O95460 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MATN4O95460 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MATN4O95460 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MATN4O95460 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MATN4O95460 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MATN4O95460 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MATN4O95460 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MATN4O95460 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN4O95460 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN4O95460 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN4O95460 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN4O95460 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN4O95460 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN4O95460 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN4O95460 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN4O95460 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN4O95460 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MATN4O95460 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN4O95460 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN4O95460 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN4O95460 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN4O95460 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN4O95460 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN4O95460 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN4O95460 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN4O95460 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN4O95460 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN4O95460 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN4O95460 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN4O95460 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN4O95460 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN4O95460 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MATN4O95460 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MATN4O95460 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MATN4O95460 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MATN4O95460 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MATN4O95460 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MATN4O95460 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MATN4O95460 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MATN4O95460 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MATN4O95460 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MATN4O95460 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN4O95460 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN4O95460 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN4O95460 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN4O95460 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN4O95460 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN4O95460 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN4O95460 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN4O95460 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MATN4O95460 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MATN4O95460 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MATN4O95460 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MATN4O95460 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MATN4O95460 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MATN4O95460 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MATN4O95460 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MATN4O95460 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MATN4O95460 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MATN4O95460 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MATN4O95460 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms