Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAPBO95292 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAPBO95292 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAPBO95292 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAPBO95292 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAPBO95292 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAPBO95292 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAPBO95292 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAPBO95292 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAPBO95292 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAPBO95292 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAPBO95292 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAPBO95292 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VAPBO95292 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAPBO95292 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAPBO95292 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VAPBO95292 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAPBO95292 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAPBO95292 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAPBO95292 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAPBO95292 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAPBO95292 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAPBO95292 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAPBO95292 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAPBO95292 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAPBO95292 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAPBO95292 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAPBO95292 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAPBO95292 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAPBO95292 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VAPBO95292 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAPBO95292 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAPBO95292 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAPBO95292 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAPBO95292 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAPBO95292 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAPBO95292 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAPBO95292 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAPBO95292 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAPBO95292 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAPBO95292 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAPBO95292 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAPBO95292 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAPBO95292 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAPBO95292 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAPBO95292 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAPBO95292 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAPBO95292 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAPBO95292 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAPBO95292 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAPBO95292 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAPBO95292 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAPBO95292 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAPBO95292 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAPBO95292 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAPBO95292 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAPBO95292 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAPBO95292 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAPBO95292 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VAPBO95292 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAPBO95292 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAPBO95292 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAPBO95292 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAPBO95292 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAPBO95292 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAPBO95292 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAPBO95292 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAPBO95292 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAPBO95292 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAPBO95292 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAPBO95292 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAPBO95292 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAPBO95292 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAPBO95292 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAPBO95292 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAPBO95292 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAPBO95292 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAPBO95292 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAPBO95292 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAPBO95292 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAPBO95292 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAPBO95292 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VAPBO95292 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAPBO95292 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VAPBO95292 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAPBO95292 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAPBO95292 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAPBO95292 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAPBO95292 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAPBO95292 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAPBO95292 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAPBO95292 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAPBO95292 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAPBO95292 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAPBO95292 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAPBO95292 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAPBO95292 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAPBO95292 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VAPBO95292 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAPBO95292 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms