Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KIF4AO95239 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIF4AO95239 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms