Protein–RNA interactions for Protein: O95206

PCDH8, Protocadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH8O95206 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH8O95206 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH8O95206 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms