Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRPF6O94906 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF6O94906 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF6O94906 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms