Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSDE1O75534 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSDE1O75534 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms