Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMPCBO75439 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMPCBO75439 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms