Protein–RNA interactions for Protein: O75436

VPS26A, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS26AO75436 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS26AO75436 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VPS26AO75436 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS26AO75436 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms