Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX3O75364 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX3O75364 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX3O75364 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX3O75364 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX3O75364 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX3O75364 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX3O75364 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX3O75364 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX3O75364 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX3O75364 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX3O75364 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX3O75364 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX3O75364 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITX3O75364 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITX3O75364 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITX3O75364 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITX3O75364 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITX3O75364 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PITX3O75364 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITX3O75364 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITX3O75364 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITX3O75364 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITX3O75364 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PITX3O75364 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PITX3O75364 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX3O75364 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX3O75364 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX3O75364 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX3O75364 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX3O75364 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX3O75364 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX3O75364 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX3O75364 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX3O75364 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX3O75364 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX3O75364 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX3O75364 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX3O75364 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX3O75364 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX3O75364 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX3O75364 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX3O75364 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX3O75364 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX3O75364 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX3O75364 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX3O75364 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX3O75364 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX3O75364 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX3O75364 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX3O75364 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX3O75364 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX3O75364 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX3O75364 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX3O75364 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX3O75364 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX3O75364 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX3O75364 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX3O75364 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX3O75364 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX3O75364 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX3O75364 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX3O75364 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX3O75364 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX3O75364 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX3O75364 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX3O75364 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX3O75364 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX3O75364 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX3O75364 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX3O75364 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX3O75364 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX3O75364 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX3O75364 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX3O75364 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX3O75364 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX3O75364 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX3O75364 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX3O75364 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX3O75364 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX3O75364 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX3O75364 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX3O75364 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX3O75364 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX3O75364 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX3O75364 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX3O75364 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX3O75364 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX3O75364 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX3O75364 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX3O75364 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX3O75364 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX3O75364 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX3O75364 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX3O75364 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX3O75364 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX3O75364 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX3O75364 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX3O75364 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PITX3O75364 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms