Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
LRP5O75197 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRP5O75197 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRP5O75197 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRP5O75197 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRP5O75197 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRP5O75197 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRP5O75197 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRP5O75197 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRP5O75197 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRP5O75197 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LRP5O75197 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRP5O75197 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LRP5O75197 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LRP5O75197 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRP5O75197 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRP5O75197 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRP5O75197 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRP5O75197 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRP5O75197 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRP5O75197 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRP5O75197 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRP5O75197 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRP5O75197 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
LRP5O75197 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRP5O75197 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRP5O75197 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRP5O75197 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRP5O75197 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRP5O75197 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRP5O75197 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRP5O75197 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRP5O75197 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRP5O75197 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRP5O75197 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRP5O75197 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRP5O75197 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRP5O75197 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRP5O75197 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRP5O75197 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
LRP5O75197 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
LRP5O75197 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
LRP5O75197 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
LRP5O75197 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRP5O75197 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRP5O75197 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRP5O75197 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRP5O75197 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRP5O75197 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
LRP5O75197 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRP5O75197 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRP5O75197 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRP5O75197 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRP5O75197 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRP5O75197 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRP5O75197 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRP5O75197 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRP5O75197 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRP5O75197 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
LRP5O75197 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRP5O75197 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRP5O75197 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRP5O75197 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
LRP5O75197 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
LRP5O75197 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRP5O75197 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRP5O75197 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRP5O75197 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRP5O75197 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRP5O75197 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRP5O75197 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRP5O75197 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRP5O75197 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRP5O75197 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRP5O75197 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRP5O75197 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
LRP5O75197 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRP5O75197 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRP5O75197 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRP5O75197 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRP5O75197 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRP5O75197 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
LRP5O75197 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRP5O75197 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRP5O75197 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRP5O75197 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRP5O75197 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRP5O75197 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
LRP5O75197 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRP5O75197 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRP5O75197 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRP5O75197 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRP5O75197 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRP5O75197 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRP5O75197 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRP5O75197 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRP5O75197 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
LRP5O75197 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRP5O75197 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRP5O75197 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms