Protein–RNA interactions for Protein: O75132

ZBED4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED4O75132 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED4O75132 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZBED4O75132 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED4O75132 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms