Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTNND1O60716 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNND1O60716 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNND1O60716 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNND1O60716 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNND1O60716 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNND1O60716 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNND1O60716 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNND1O60716 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CTNND1O60716 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNND1O60716 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms