Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSPAN2O60636 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSPAN2O60636 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSPAN2O60636 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSPAN2O60636 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSPAN2O60636 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TSPAN2O60636 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSPAN2O60636 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms