Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN3BO60391 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GRIN3BO60391 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIN3BO60391 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms