Protein–RNA interactions for Protein: O60343

TBC1D4, TBC1 domain family member 4, humanhuman

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Length 1,298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D4O60343 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBC1D4O60343 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBC1D4O60343 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBC1D4O60343 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBC1D4O60343 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBC1D4O60343 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBC1D4O60343 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBC1D4O60343 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBC1D4O60343 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBC1D4O60343 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBC1D4O60343 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TBC1D4O60343 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBC1D4O60343 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBC1D4O60343 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBC1D4O60343 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBC1D4O60343 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBC1D4O60343 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBC1D4O60343 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBC1D4O60343 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
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TBC1D4O60343 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TBC1D4O60343 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TBC1D4O60343 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TBC1D4O60343 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TBC1D4O60343 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TBC1D4O60343 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBC1D4O60343 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBC1D4O60343 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBC1D4O60343 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBC1D4O60343 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBC1D4O60343 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBC1D4O60343 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBC1D4O60343 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBC1D4O60343 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBC1D4O60343 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TBC1D4O60343 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TBC1D4O60343 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBC1D4O60343 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBC1D4O60343 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBC1D4O60343 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBC1D4O60343 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBC1D4O60343 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBC1D4O60343 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBC1D4O60343 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBC1D4O60343 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBC1D4O60343 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
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