Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMPRSS11DO60235 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS11DO60235 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms