Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNGR2O43760 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR2O43760 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms