Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DENRO43583 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DENRO43583 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DENRO43583 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DENRO43583 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DENRO43583 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DENRO43583 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DENRO43583 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DENRO43583 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DENRO43583 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DENRO43583 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DENRO43583 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DENRO43583 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DENRO43583 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DENRO43583 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DENRO43583 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DENRO43583 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DENRO43583 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DENRO43583 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DENRO43583 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DENRO43583 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DENRO43583 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DENRO43583 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DENRO43583 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DENRO43583 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DENRO43583 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DENRO43583 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DENRO43583 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DENRO43583 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DENRO43583 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DENRO43583 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DENRO43583 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DENRO43583 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DENRO43583 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DENRO43583 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DENRO43583 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DENRO43583 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DENRO43583 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DENRO43583 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DENRO43583 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DENRO43583 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DENRO43583 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DENRO43583 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DENRO43583 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DENRO43583 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DENRO43583 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DENRO43583 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DENRO43583 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DENRO43583 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DENRO43583 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DENRO43583 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DENRO43583 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DENRO43583 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DENRO43583 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DENRO43583 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DENRO43583 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DENRO43583 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DENRO43583 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DENRO43583 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DENRO43583 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DENRO43583 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DENRO43583 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DENRO43583 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DENRO43583 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DENRO43583 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DENRO43583 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DENRO43583 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
DENRO43583 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DENRO43583 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
DENRO43583 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DENRO43583 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DENRO43583 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DENRO43583 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DENRO43583 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DENRO43583 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DENRO43583 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DENRO43583 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DENRO43583 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DENRO43583 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DENRO43583 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DENRO43583 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DENRO43583 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DENRO43583 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DENRO43583 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DENRO43583 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DENRO43583 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DENRO43583 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DENRO43583 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DENRO43583 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DENRO43583 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DENRO43583 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DENRO43583 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DENRO43583 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DENRO43583 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DENRO43583 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DENRO43583 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DENRO43583 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DENRO43583 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DENRO43583 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DENRO43583 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms