Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA2O43464 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HTRA2O43464 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTRA2O43464 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms