Protein–RNA interactions for Protein: O43435

TBX1, T-box transcription factor TBX1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX1O43435 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TBX1O43435 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TBX1O43435 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TBX1O43435 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TBX1O43435 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TBX1O43435 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TBX1O43435 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TBX1O43435 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TBX1O43435 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TBX1O43435 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TBX1O43435 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TBX1O43435 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TBX1O43435 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TBX1O43435 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TBX1O43435 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TBX1O43435 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TBX1O43435 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TBX1O43435 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TBX1O43435 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TBX1O43435 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TBX1O43435 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TBX1O43435 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TBX1O43435 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TBX1O43435 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TBX1O43435 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TBX1O43435 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TBX1O43435 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TBX1O43435 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TBX1O43435 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TBX1O43435 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TBX1O43435 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TBX1O43435 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TBX1O43435 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TBX1O43435 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TBX1O43435 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TBX1O43435 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TBX1O43435 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TBX1O43435 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TBX1O43435 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TBX1O43435 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TBX1O43435 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TBX1O43435 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TBX1O43435 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TBX1O43435 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TBX1O43435 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TBX1O43435 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TBX1O43435 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TBX1O43435 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TBX1O43435 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TBX1O43435 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TBX1O43435 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TBX1O43435 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TBX1O43435 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TBX1O43435 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TBX1O43435 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TBX1O43435 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TBX1O43435 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TBX1O43435 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TBX1O43435 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TBX1O43435 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TBX1O43435 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TBX1O43435 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TBX1O43435 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TBX1O43435 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TBX1O43435 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TBX1O43435 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TBX1O43435 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TBX1O43435 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TBX1O43435 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TBX1O43435 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TBX1O43435 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TBX1O43435 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBX1O43435 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TBX1O43435 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBX1O43435 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBX1O43435 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBX1O43435 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBX1O43435 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBX1O43435 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBX1O43435 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBX1O43435 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBX1O43435 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBX1O43435 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBX1O43435 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TBX1O43435 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBX1O43435 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBX1O43435 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBX1O43435 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBX1O43435 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBX1O43435 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TBX1O43435 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBX1O43435 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBX1O43435 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TBX1O43435 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBX1O43435 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBX1O43435 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBX1O43435 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBX1O43435 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TBX1O43435 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TBX1O43435 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms