Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SART1O43290 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SART1O43290 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SART1O43290 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SART1O43290 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SART1O43290 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SART1O43290 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SART1O43290 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SART1O43290 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SART1O43290 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SART1O43290 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SART1O43290 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SART1O43290 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SART1O43290 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SART1O43290 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SART1O43290 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SART1O43290 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SART1O43290 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SART1O43290 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SART1O43290 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SART1O43290 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SART1O43290 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SART1O43290 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SART1O43290 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SART1O43290 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SART1O43290 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SART1O43290 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SART1O43290 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SART1O43290 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SART1O43290 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SART1O43290 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SART1O43290 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SART1O43290 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SART1O43290 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SART1O43290 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SART1O43290 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SART1O43290 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SART1O43290 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SART1O43290 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SART1O43290 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SART1O43290 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SART1O43290 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SART1O43290 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SART1O43290 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SART1O43290 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SART1O43290 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SART1O43290 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SART1O43290 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SART1O43290 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SART1O43290 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SART1O43290 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SART1O43290 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SART1O43290 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SART1O43290 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SART1O43290 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SART1O43290 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SART1O43290 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SART1O43290 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SART1O43290 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SART1O43290 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SART1O43290 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SART1O43290 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SART1O43290 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SART1O43290 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SART1O43290 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SART1O43290 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SART1O43290 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SART1O43290 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SART1O43290 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SART1O43290 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SART1O43290 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SART1O43290 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SART1O43290 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SART1O43290 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SART1O43290 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SART1O43290 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SART1O43290 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SART1O43290 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SART1O43290 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SART1O43290 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SART1O43290 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SART1O43290 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SART1O43290 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SART1O43290 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SART1O43290 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SART1O43290 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SART1O43290 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SART1O43290 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SART1O43290 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SART1O43290 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SART1O43290 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SART1O43290 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SART1O43290 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SART1O43290 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SART1O43290 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SART1O43290 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SART1O43290 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SART1O43290 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SART1O43290 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SART1O43290 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms